Evidence Network

과학적 Evidence 네트워크

CREAIM은 다수 과학 데이터베이스를 단순 집계하지 않습니다. 각 소스를 정해진 과학적 역할과 evidence scope로 연결하고, Runtime Computing™으로 계산한 뒤, 독립 evidence와 observed outcome으로 다시 검증합니다.

CREAIM 연결 흐름
분자분자 Evidence표적 Biology경로인간 Evidence생물체 Evidence네트워크 EvidenceRuntime Computing™실패 / 위험 평가과학적 결정결정 동결라이브 검증

Evidence alone does not make the decision. Evidence → Runtime Computing™ → Failure Elimination → Scientific Decision → Decision Freeze → Live Validation

분자 증거

이 분자가 무엇이며 표적과 어떻게 상호작용하는가?

역할:Molecule identity, binding / activity, assay context, chemical evidence

생물학적 증거

이 표적과 생물학적 기전이 실제 질환 및 생물학과 연결되는가?

역할:Target-disease evidence, pathway, phenotype, function, organism biology, cross-species concordance

Open Targets

CONNECTED

이 source가 무엇을 알려주는가

다수 직교 evidence 스트림 집계된 표적-질병 연관 점수.

CREAIM 결정 과정에서 어떻게 사용하는가

생물학적 교차검증 1축 (표적-질병), 읽기 전용; 후보 효능 신호로 절대 사용 안 함.

이 evidence만으로 무엇을 증명할 수 없는가

연관 ≠ 인과 검증. 데이터베이스 evidence ≠ wet-lab 확인.

TARGET_LEVEL기술 상세

Reactome

CONNECTED

이 source가 무엇을 알려주는가

표적에 대한 큐레이션된 인간 생물학적 경로 할당.

CREAIM 결정 과정에서 어떻게 사용하는가

생물학적 교차검증 2축 (경로), 표적에 대한 기전 수준 맥락.

이 evidence만으로 무엇을 증명할 수 없는가

경로 소속 ≠ 표적 효능. 경로 맥락 ≠ 임상 검증.

MECHANISM_LEVEL기술 상세

WormBase

CONNECTED

이 source가 무엇을 알려주는가

모델 생물 ortholog에 대한 유전자 기능, 표현형, organism 수준 biology.

CREAIM 결정 과정에서 어떻게 사용하는가

인간 표적과 C. elegans ortholog 간 종간 일치 (3축).

이 evidence만으로 무엇을 증명할 수 없는가

WormBase SUPPORT ≠ wet-lab 검증. WormBase SUPPORT ≠ 임상 검증. WormBase SUPPORT ≠ VERIFIED.

ORGANISM_LEVEL기술 상세

C. elegans Experiment

CONNECTED

이 source가 무엇을 알려주는가

ortholog에 대해 큐레이션된 C. elegans LOF / 표현형 실험.

CREAIM 결정 과정에서 어떻게 사용하는가

생물학적 교차검증 4축 (organism experiment), 읽기 전용.

이 evidence만으로 무엇을 증명할 수 없는가

생물학적 실험 ≠ 임상 evidence. 모델 생물 표현형 ≠ 인간 효능.

ORGANISM_LEVEL기술 상세

인간 근거

인간 유전학 및 조직 수준에서도 근거가 존재하는가?

역할:Clinical genetics, population genetics, human tissue expression

네트워크 증거

표적이 더 넓은 생물학적 시스템에서 어떻게 연결되는가?

역할:Interaction network, dependency, systems context

과학 문헌

공개 문헌이 표적-질환 맥락에 대해 무엇을 말하는가?

역할:Target–disease literature context — publication counts, recency, and references

검증 증거

CREAIM이 사전에 내린 결정이 이후 실제 evidence와 얼마나 일치하는가?

역할:Decision-first → freeze → reveal → concordance verification

GroundTruth

CONNECTED

이 source가 무엇을 알려주는가

동결된 벤치마크 ground-truth 라벨은 오직 STAGE7 reveal 시 소비; runtime 계산에 절대 사용 안 함.

CREAIM 결정 과정에서 어떻게 사용하는가

Stage 4 anti-leakage holdout + Stage 7 예측 일치도 검증.

이 evidence만으로 무엇을 증명할 수 없는가

Ground truth 수집 단독 ≠ VERIFIED. 일치도 기록만, 자동 승격 없음.

GROUND_TRUTH기술 상세

Independent Review (C10)

CONNECTED

이 source가 무엇을 알려주는가

동결된 결정 trace에 대한 독립 검토자 서명 (reviewer_id ≠ compiler).

CREAIM 결정 과정에서 어떻게 사용하는가

C10 VERIFIED 게이트 승격 전용; 자동 승격 없음; reveal 전제조건 절대 아님.

이 evidence만으로 무엇을 증명할 수 없는가

C10 증명 ≠ wet-lab 확인. Verified ≠ authoritative.

CLINICAL기술 상세

Wet-Lab (C12)

PENDING_VALIDATION

이 source가 무엇을 알려주는가

실제 trace 수집 시에만 wet-lab assay 레코드 보존.

CREAIM 결정 과정에서 어떻게 사용하는가

C12 WetLabAssayTraceV1_11 qualifying rule; qualifying=true ≠ VERIFIED 자동; 승격은 검토자 서명 필요.

이 evidence만으로 무엇을 증명할 수 없는가

qualifying wet-lab trace는 VERIFIED 자동 아님. Wet-Lab ≠ 검토자 서명 없이 AUTHORITATIVE.

WET_LAB기술 상세

Prospective Validation

CONNECTED

이 source가 무엇을 알려주는가

동결된 v1 선택과 새 post-selection evidence 비교 (Temporal Integrity).

CREAIM 결정 과정에서 어떻게 사용하는가

Stage 4 ProspectiveSelectionValidationV1_11; 선택 v1 결코 변형 안 함; 새 복합 점수 없음.

이 evidence만으로 무엇을 증명할 수 없는가

일치도 ≠ 효능 증명. 일치도는 기록만, 자동 승격 없음.

GROUND_TRUTH기술 상세

Live Validation

CONNECTED

이 source가 무엇을 알려주는가

Decision v1 동결 snapshot과 외부 evidence + 관측 outcome 비교.

CREAIM 결정 과정에서 어떻게 사용하는가

Stage 7 독립 라이브 검증; decision_hash 불변 증명; Engine25 재실행 결코 안 함.

이 evidence만으로 무엇을 증명할 수 없는가

라이브 검증 자체 ≠ 과학적 검증. API 연결 ≠ 과학적 검증.

CLINICAL기술 상세

Source Status Matrix

실제 상태만 표시 (CONNECTED · PARTIAL · NOT_AVAILABLE · PENDING_VALIDATION)

CONNECTION은 설정 상태(configured)이며, 실시간 상태는 /APIDataSources(checkApiStatus) 기준입니다.

소스과학적 역할EVIDENCE SCOPE연결가용성추적성검증 상태
BindingDB분자 identity, 결합 / 활성, assay 맥락, 화학적 evidenceCANDIDATE_LEVEL
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING
ChEMBL분자 identity, 결합 / 활성, assay 맥락, 화학적 evidence (종간 직교성)CANDIDATE_LEVEL
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING
AlphaFold DB부가적 표적 구조 맥락 (예측, SHADOW, 결정 분리)TARGET_LEVEL
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLE (fail-closed)VALIDATION_PENDING
Open Targets표적-질병 연관 evidenceTARGET_LEVEL
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING
Reactome생물학적 경로 맥락MECHANISM_LEVEL
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING
WormBase모델 생물학적 일치 (C. elegans)ORGANISM_LEVEL
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING
C. elegans Experiment생물학적 실험 evidence (큐레이션)ORGANISM_LEVEL
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING
ClinVar인체 임상 유전학HUMAN_GENETIC
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING
GWAS Catalog집단 유전 연관HUMAN_GENETIC
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING
GTEx인체 조직 발현HUMAN_GENETIC
NOT_AVAILABLE
NOT_AVAILABLEFAIL-CLOSED (NOT_AVAILABLE persisted)NOT_EVIDENCED
STRING상호작용 네트워크 맥락TARGET_LEVEL
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING
BioGRID상호작용 네트워크 (보조)TARGET_LEVEL
NOT_AVAILABLE
NOT_AVAILABLEFAIL-CLOSED (NOT_AVAILABLE persisted)NOT_EVIDENCED
DepMap의존성 / 시스템 맥락TARGET_LEVEL
NOT_AVAILABLE
NOT_AVAILABLEFAIL-CLOSED (NOT_AVAILABLE persisted)NOT_EVIDENCED
PubMed (NCBI)과학 문헌 맥락 (NCBI PubMed, 실시간)TARGET_LEVEL_CONTEXTUAL
CONNECTEDconfigured
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING
GroundTruth동결된 ground-truth 세트 (holdout)GROUND_TRUTH
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING (reveal-gated)
Independent Review (C10)독립 과학 검토자 증명 (C10)CLINICAL
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING (reviewer-gated)
Wet-Lab (C12)Wet-lab assay trace (C12 qualifying rule)WET_LAB
PENDING_VALIDATION
PENDING_VALIDATIONPROVENANCE TRACEABLE when ingestedPENDING_VALIDATION (reviewer-gated)
Prospective Validation선택 이후 예측 일치도GROUND_TRUTH
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING
Live ValidationStage 7 독립 라이브 검증CLINICAL
CONNECTED
CONNECTEDPROVENANCE TRACEABLEVALIDATION_PENDING (reviewer-gated)
SCIENTIFIC CLAIM GUARDS

표적 수준 지지 ≠ 후보 효능

생물체 지지 ≠ 인간 검증

데이터베이스 evidence ≠ wet-lab

실제 ≠ 검증됨 ≠ 공식

지지 ≠ 검증됨

API 연결 ≠ 과학적 검증

현재 실제 확보되기 전 상태는 NOT_AVAILABLE / PENDING으로 표시; 가짜 evidence 생성 금지.

Evidence Network는 WHAT + SCIENTIFIC ROLE, Evidence & Traceability는 SOURCE + PROVENANCE + HASH + VERSION + TRACEBACK. 페이지 중복 없이 역할 분리.